La mission principale dévolue au CTH, définie et explicitée par ses statuts, consiste en la réalisation du Contrôle Technique des travaux d'ouvrages et infrastructures hydrauliques et des équipements qui leur sont destinés.

A ce titre, le CTH assure, notamment, les activités suivantes:

La mission 'Contrôle Plan' qui porte sur le contrôle des documents graphiques et écrits élaborés au stade des études.

La mission 'Contrôle Chantiers' qui porte sur le contrôle de la réalisation des travaux

La mission 'Contrôle Composants' qui porte sur le contrôle de qualité des matériaux et équipements constitutifs des ouvrages et équipements par référence aux spécifications contractuelles.